La Facultad de Ciencias desarrolla su labor académica a través de cinco Departamentos: Estadística, Física, Matemática, Química y Ciencias Básicas, los cuatro primeros ubicados en el campus Concepción y el quinto en Chillán.

Dictan las asignaturas de ciencias básicas (Matemáticas, Física, Química y Biología) a las carreras de pregrado que imparte la Universidad y a los programas de postgrado y postítulo que lo requieren. Además, ofrece en ambas Sedes de la Universidad, el Bachillerato en Ciencias Naturales y Exactas, programa de cuatro semestres conducente al grado académico de Bachiller. Desde el año 2001, se imparte la carrera de Ingeniería Estadística, en el campus Concepción, desde año 2011 la carrera de Ingeniería en Recursos Naturales y, desde el 2023, Química y Farmacia, en el campus Fernando May de Chillán.